WH0209 DNA末端修復/加dA尾試劑(I

產(chǎn)品簡介
DNA末端修復/加dA尾試劑(I是高品質(zhì)的基因結(jié)構(gòu)和功能產(chǎn)品,由北京百奧萊博供應(yīng),本產(chǎn)品用于生化實驗研究等領(lǐng)域,本品質(zhì)量穩(wěn)定,價位合理,需要DNA末端修復/加dA尾試劑(I等基因結(jié)構(gòu)和功能產(chǎn)品的客戶,請到我公司官網(wǎng)聯(lián)系我們。...
產(chǎn)品詳細介紹
特別提示:包括DNA末端修復/加dA尾試劑(Illumina)在內(nèi),本公司的所有產(chǎn)品僅可用于科研實驗,嚴禁用于臨床醫(yī)療及其他非科研用途!
產(chǎn)品名稱:DNA末端修復/加dA尾試劑(Illumina)
英文名稱:End Repair/dA-Tailing Reagent(Illumina)
產(chǎn)品貨號:WH0209
產(chǎn)品規(guī)格:24次|96次
本制品是專門針對于illumina高通量測序平臺文庫構(gòu)建所優(yōu)化預(yù)混酶模塊,能夠?qū)Τ曁幚怼⒒瘜W處理、酶處理的片段化雙鏈DNA或小片段DNA的末端進行修復,使DNA雙鏈形成平末端,并分別在片段化DNA兩端添加5"-P和3"端dA,所得產(chǎn)物無需純化,直接用于Fast Ligation Reagent(WH0201-01/02)進行DNA片段的adapter連接。本試劑盒采用一步法反應(yīng)流程,省去了多步純化步驟,可對低DNA樣本進行、快速末端修復及dA尾添加,操作更加簡便,文庫轉(zhuǎn)化效率更高。
產(chǎn)品特點:
·單管酶促反應(yīng),一步完成雙鏈DNA片段的末端修復、dA添加反應(yīng)。
·高文庫轉(zhuǎn)化效率,DNA樣本其實量可低至0.25ng。
產(chǎn)品組成:
組分 | 24次 | 96次 |
5×ERA Enzyme Mix | 240μl | 960 μl |
10×ERA Buffer | 120 μl | 480 μl |
Nuclease-Free ddH2O | 1ml | 4×1ml |
保存條件:-25~-15℃保存,避免反復凍融,保質(zhì)期為一年。
注意事項:(請務(wù)必在使用本試劑盒之前閱讀此注意事項)
1.操作過程請注意避免核酸樣品和產(chǎn)物之間的交叉污染。
2.請使用不含RNA酶或DNA酶的槍頭、EP管進行試驗。
3.試驗開始前,請清潔操作臺,確保沒有RNA酶和DNA酶的污染。
4.進行文庫擴增前,請確保PCR儀已經(jīng)調(diào)試好并處于穩(wěn)定的狀態(tài)。
5.試驗前請仔細閱讀說明書,如果需要暫停試驗,或者無需立即進行下游試驗。可根據(jù)說明書推薦將試驗產(chǎn)物保存于-20℃并安排后續(xù)試驗。
推薦使用的其他試劑:
1.Fast Ligation Reagent(WH0201-01/02)
2.Single-Indexed Adapter (Illumina Platforms)(WH0206-01/02/03)
3.NGS Library Amplification Reagent(WH0210-01/02)
操作步驟:
準備開始實驗前,了解樣本DNA的濃度及Buffer成分至關(guān)重要,推薦上樣量0.25ng~1μg DNA。我們推薦DNA溶解于以下溶液中:去離子水、Buffer EB或LoTE(0.1×TE)。
1.將10×ERA Buffer和5×ERA Enzyme Mix置于冰上融化,短暫混勻。
2.按下表設(shè)置PCR儀程序,熱蓋溫度設(shè)置為70℃。
操作步驟 | 溫度 | 時間 |
1 | 4℃ | 1min |
2 | 20℃ | 30min |
3 | 65℃ | 30min |
4 | 4℃ | 保持溫度 |
3.取1個的200 μl薄壁管,按下表在冰上配置反應(yīng)體系。
成分 | 用量 |
10×ERA buffer | 5 μl |
DNA sample | X μl |
Nuclease-Free ddH2O | (35-X) μl |
Total | 40 μl |
4.向步驟3的薄壁管中加入10 μl 5×ERA Enzyme Mix,輕柔吸打6-8次混勻,注意不要渦旋。
注:此步驟需要保持在冰浴中進行。
5.將配置好反應(yīng)體系的薄壁管放入4℃預(yù)冷的PCR儀中,并開啟步驟2中的程序。
6.當反應(yīng)程序結(jié)束后,將薄壁管從PCR儀中取出并置冰上。
7.立即進入接頭連接步驟,為保證連接效率,推薦使用Fast Ligation Reagent(WH0201-01/02)。
根據(jù)您的關(guān)注的DNA末端修復/加dA尾試劑(Illumina),您可能還對以下產(chǎn)品有需求:
名稱:DNA文庫定量試劑盒(Ion Torrent平臺)
貨號:WE0233
規(guī)格:1ml|5ml
本產(chǎn)品是采用染料法(SYBR Green I)對NGS建庫后的產(chǎn)物進行實時熒光定量PCR(qPCR)。試劑盒提供了qPCR過程所需的反應(yīng)混合液,DNA引物混合物、標準品以及樣品稀釋液,試劑體系完整,操作簡單方便。反應(yīng)混合物中所含的熒光染料SYBR Green I 可以與所有的雙鏈DNA結(jié)合;使用的BaldStar Taq DNA Polymerase是一種經(jīng)化學修飾的全新熱啟動聚合酶,酶的激活需在95℃下孵育10 min。該產(chǎn)品特異性強、擴增效率高,能夠?qū)?gòu)建的文庫濃度進行快速準確的定量。
ROX染料用于校正定量PCR儀孔與孔之間產(chǎn)生的熒光信號誤差,一般用于ABI、Stratagene等公司的Real Time PCR擴增儀。不同儀器的激發(fā)光學系統(tǒng)有所不同,因此ROX染料的濃度必須與相應(yīng)的熒光定量PCR儀相匹配。
不需要ROX校正的儀器: Roche LightCycler 480,Roche LightCyler 96,Bio-radiCyler iQ,iQ5,CFX96等。
需要Low ROX校正的儀器: ABI Prism7500/7500 Fast,QuantStudio® 3 System,QuantStudio® 5 System, QuantStudio® 6 Flex System,QuantStudio® 7 Flex System,ViiA 7 system, Stratagene Mx3000/Mx3005P,Corbett Rotor Gene 3000等。
需要High ROX校正的儀器: ABI Prism7000/7300/7700/7900,Eppendorf,ABI Step One/Step One Plus等。
名稱:Bcl-X/L mRNA原位雜交試劑盒
貨號:ZN0125
規(guī)格:100T
基本信息:
保存條件:4℃保存一年
工作量:100張切片。
有效期:一年。
適用種屬:human,rat,mouse
標記方式:3’—尾段標記
試劑盒中內(nèi)容:
1.胃蛋白酶(×10; Pepsin)2ml;
2.預(yù)雜交液 2ml;
3.Bcl-X/L mRNA原位雜交試劑盒寡核苷酸探針雜交液 2ml;
4.封閉液 5ml;
5.生物素化鼠抗dì高辛 5ml;
6.SABC-POD 5ml;
7.生物素化過氧化物酶 5ml。
用戶自備試劑:
原位雜交專用蓋玻片;POLY-L-LYSINE;DEPC;20%甘油
緩沖液(3%檸檬酸,2×SSC,0.5×SSC,0.2×SSC,原位雜交用 PBS)
一.培養(yǎng)細胞和冰凍切片
準備工作:
固定液:4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6);1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6)
3%檸檬酸——100ml蒸餾水中加檸檬酸(C6H8O7?H2O)3g,PH2.0左右。
2×SSC——1000ml蒸餾水中加氯化鈉17.6g,檸檬酸三鈉(C6H5O7Na3?2H2O,分子量294)8.8g。
0.5×SSC——300ml蒸餾水加100ml 2×SSC即可。
0.2×SSC——270ml蒸餾水加30ml 2×SSC即可。
20%甘油——20ml甘油加80ml蒸餾水即可。
原位雜交用PBS(1000ml蒸餾水加氯化鈉30g,Na2HPO4?12H2O 6g,NaH2PO4?2H2O 0.4g),PH7.2-7.6。
操作程序:
注意:zuì重要的是及時固定,并在固定液中加入0.1%的DEPC處理,以抑制RNA酶對mRNA的分解作用。此外,過度固定對原位雜交有明顯的不利影響。
1.玻片的處理:一般采用多聚賴氨酸或APES。切片厚度10-20μm。
2.細胞在多聚賴氨酸處理的蓋玻片上進行培養(yǎng),條件為37℃和5%的CO2,所用培養(yǎng)基為Dulbecco基礎(chǔ)培養(yǎng)基。細胞長好后0.1M PBS(PH7.4)洗2分鐘×3次。
3.培養(yǎng)細胞和冰凍切片均可用下述方法固定:固定液為4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室溫固定 20--30分鐘。蒸餾水充分洗滌,干燥后-20℃冰凍可保存2周以上。
4.30%H2O2 1份+純甲醇50份混合,室溫處理30分鐘。蒸餾水洗滌3次。
5.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%檸檬酸新鮮稀釋的胃蛋白酶(1ml 3% 檸檬酸加2滴濃縮型胃蛋白酶,混勻),37℃或室溫消化5—120秒鐘。有時也可以不消化。原位雜交用 PBS洗3次×5分鐘。蒸餾水洗1次。
6.后固定:胃蛋白酶消化后才需要。固定液為1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室溫固定 10分鐘。蒸餾水洗滌3次。
7.預(yù)雜交:濕盒的準備——干的雜交盒底部加20%甘油20ml以保持濕度。按每張切片20μι加預(yù)雜交液。恒溫箱38-42℃2—4小時。吸取多余液體,不洗。
8.雜交——按每張切片20μι雜交液,加在切片上。將原位雜交專用蓋玻片的保護膜揭開后,蓋在切片上。恒溫箱38-42℃雜交過夜(根據(jù)雜交情況可以調(diào)節(jié))。
9.雜交后洗滌:揭掉蓋玻片,37℃左右水溫的2×SSC洗滌5分鐘×2次;37℃0.5×SSC洗滌15分鐘×1次; 37℃0.2×SSC洗滌15分鐘×1次(如果有非特異性染色,重復0.2×SSC洗滌15分鐘×1-2次)。
10.滴加封閉液:37℃30分鐘。甩去多余液體,不洗
11.滴加生物素化鼠抗dì高辛:37℃ 60分鐘或室溫120分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×4次。勿用其它緩沖液和蒸餾水洗滌。
12.滴加SABC:37℃20分鐘或室溫30分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×3次。勿用其它緩沖液和蒸餾水洗滌。
13.滴加生物素化過氧化物酶:37℃20分鐘或室溫30分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×4次。
14.DAB顯色:使用DAB顯色試劑盒—1ml蒸餾水加顯色劑A,B,C各一滴,混勻,加至標本上。一般顯色20-30分鐘。若無背景出現(xiàn)則可繼續(xù)顯色。也可自配DAB顯色劑后顯色。充分水洗。
15.必要時蘇木素復染,充分水洗。
16.酒精脫水,二甲苯透明,封片。
二.石蠟切片
如果有條件的話,應(yīng)盡可能地采用新鮮標本。標本離體后,及時予以固定。固定液為4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.0-7.6),含有1/1000 DEPC。標本較大時用刀片切成厚度不超過4mm的小塊,固定1小時即可,較大的標本固定不要超過2小時。某些組織對過度固定尤其敏感,如動物大腦,固定時間30-40分鐘,一般不要超過1小時。
1.常規(guī)脫水、浸蠟、包埋。切片厚度6-8μm。
2.玻片的處理:一般采用多聚賴氨酸或APES。
3.石蠟切片經(jīng)常規(guī)脫蠟至水。30%H2O2 1份+蒸餾水10份混合,室溫5-10分鐘以滅活內(nèi)源性酶。蒸餾水洗3次。
4.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%檸檬酸新鮮稀釋的胃蛋白酶(1ml 3% 檸檬酸加2滴濃縮型胃蛋白酶,混勻),37℃或室溫消化3--30分鐘(視標本新舊、厚薄自行調(diào)整)。用戶可以比較不同的消化時間,例如5分鐘,10分鐘,20分鐘,30分鐘。以找到zuì佳的消化時間。原位雜交用PBS洗3次×5分鐘。蒸餾水洗1次。其余步驟和冰凍切片6-16步相同。
結(jié)果觀察:
Bcl-X/L的細胞胞漿著色呈棕黃色。
注意事項:
由于特定的mRNA序列僅占總mRNA的少數(shù),加上基因僅由四個堿基排列組合而成,因此原位雜交容易出現(xiàn)非特異性染色。通過不加探針和用陰性標本做對照,基本可以確定染色是否為特異性的。有明顯的非特異性染色現(xiàn)象時,用預(yù)雜交液對含探針的雜交液進行稀釋,一般稀釋2—10倍;并應(yīng)加強探針雜交后的洗滌。如果有少量的細胞核著色屬于正常情況;如果出現(xiàn)大量的細胞核著色,往往和標本固定時間過長有關(guān),應(yīng)重新處理標本。
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