質粒DNA的酶切原理和操作步驟

  1.目的

  學會用限制性內切酶切割質粒DNA。

  2.原理

  II型限制性內切酶能識別雙鏈DNA內部的特殊序列并在識別位點處將雙鏈切斷，形成粘性末端或齊平末端，通過電泳酶切后的DNA混合物能夠確認和分離酶切片段。

  3.器材

  旋渦混合器，微量移液取樣器，移液器吸頭，1.5ml微量離心管，雙面微量離心管架，水漂，恒溫水浴。

  4.試劑

  Pinpoint?xa-3質粒，EcoR V，BamH I，內切酶緩沖液(10×)，10×電泳加樣緩沖液，熒光染料。

  5.實驗準備

  配制TAE電泳緩沖液(50?儲存液)，10?加樣緩沖液，1.5ml離心管裝入鋁制飯盒(滅菌)、移液器吸頭裝入相應的吸頭盒(滅菌)。

  6.操作步驟

  (1)混合下列溶液于一個無菌的1.5ml微量離心管中：

  Pinpoint?xa-3 DNA (或pUCm-T-CHI ) 6 μl

  10×酶切緩沖液(用EcoRV的緩沖液) 2 μl

  ddH2O 30 μl

  EcoRV 1μl

  BamHI 1μl

  總體積 40μl

  (2)先準備一個冰盒并放入一定量的冰塊。從-20℃冰柜中取出限制性內切酶，立即插入冰塊中。

  (3)用一只手的手指捏在盛放酶的微量離心管的上部(以免手指的給酶液加溫)，另一只手持微量移液器，小心翼翼地吸取1 μl限制性內切酶。

  (4)在酶切樣品混合液中加入限制性內切酶后(立即把內切酶原液送回冰柜!)，輕輕震動微量離心管使管中的溶液混勻。再在離心機中1000rpm離心10秒。取出后插到水漂的孔中，在推薦的適酶切溫度水浴中溫育1~3 h(一般是 37℃)。

  (5)酶切后取少量酶切產物與合適的已知分子量的DNA(如先前的PCR產物)對比電泳，以確認切下的片斷是否為自己想要的片斷。

  (6)酶切后的質粒可以回收備用(見實驗六：從瓊脂糖凝膠中回收DNA片段)。

  (7)清理桌面垃圾，清洗實驗儀器。撰寫實驗報告。

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